Penelitian ini bertujuan untuk untuk menguji seberapa besar pengaruh Pelaksanaan Pengendalian Internal, Fungsi Audit Internal dan Pelaksanaan Good University Governance terhadap Kualitas Laporan Keuangan pada perguruan tinggi BHMN. Mengingat pentingnya Kualitas Laporan Keuangan, hal ini diketahui bahwa BAKN menemukan adanya potensi penyimpangan terhadap pengelolaan keuangan dan Laporan keuangan di Kemendiknas, khususnya perguruan tinggi BHMN. Desain yang digunakan adalah desain kausalitas. Sedangkan metode yang digunakan adalah survei. Adapun analisis yang digunakan adalah analisis jalur. Penelitian ini dilakukan pada 7 (tujuh) perguruan tinggi BHMN di Indonesia. Hasil analisis menunjukkan bahwa: (1) Secara simultan pelaksanaan pengendalian internal, fungsi audit internal dan pelaksanaan good university governance memberikan pengaruh secara positif sebesar 70,2% terhadap kualitas laporan keuangan ; (2) Secara parsial pengendalian internal, fungsi audit internal dan good university governance memberikan pengaruh secara positif, besarnya pengaruh tersebut secara berurut adalah sebesar 45,4%, 13,8% dan 11,0%.